Uma equipa de investigação do Instituto de Investigação da Leucemia Josep Carreras desenvolveu um novo método para integrar dados multiómicos de célula única, permitindo uma identificação mais precisa de tipos e estados celulares raros em tecidos e órgãos. O estudo, publicado na revista "Genome Biology", foi liderado pela Dra. Elisabetta Mereu e realizado em colaboração com investigadores do Instituto de Tecnologia de Massachusetts (MIT) e da Universidade de Harvard.
A equipa introduziu uma ferramenta de aprendizagem automática chamada scOMM, utilizada para classificar e comparar tipos celulares em diferentes métodos de análise de célula única. Esta ferramenta já está disponível publicamente e foi testada em tecidos renais, sanguíneos e cardíacos. Ao integrar múltiplas modalidades de dados, como scRNAseq e snATACseq, os investigadores conseguiram aprofundar a compreensão da diversidade celular, superando as limitações dos métodos individuais e permitindo uma caracterização mais abrangente de tecidos complexos.
Como prova de conceito, a equipa analisou amostras renais de 19 dadores, totalizando 199.744 células. Após a integração dos dados multiómicos de célula única, identificaram com sucesso dois tipos celulares raros associados a órgãos doentes, que anteriormente não haviam sido detetados nos atlas celulares renais existentes. Isto demonstra o potencial dos métodos de integração para melhorar a precisão na identificação celular, contribuindo para o avanço do Projeto Atlas de Células Humanas, que envolve 18 redes científicas de 103 países.
A equipa também validou a sua estratégia de integração em conjuntos de dados cardíacos e renais independentes, com resultados que indicam que o método é robusto e transferível, podendo ser aplicado a diferentes tecidos e protocolos experimentais. Esta abordagem de integração de dados multiómicos de célula única abre novos caminhos para uma melhor caracterização da heterogeneidade celular em doenças como leucemia e linfoma, com potencial para impulsionar avanços na área da saúde e na investigação médica.
Detalhes da publicação: Autores: Instituto de Investigação da Leucemia Josep Carreras; Título: "Integration of single-cell multiomics data allows a more precise identification of rare cell types and states"; Publicado em: "Genome Biology" (2026).
