De acordo com pt.wedoany.com-A Merck & Co. firmou um acordo de descoberta e licenciamento de múltiplos alvos com a Protillion Biosciences, empresa de design de medicamentos com inteligência artificial, visando utilizar o método "lab-in-the-loop" da Protillion e sua plataforma de descoberta de anticorpos em chip Prot-MaP™ para identificar vários candidatos a novas terapias. De acordo com o acordo, a Merck pagará à Protillion um valor não divulgado como adiantamento, além de pagamentos de marcos de pesquisa, desenvolvimento e comerciais de até US$ 510 milhões.
Esta colaboração visa combinar a expertise da Merck na descoberta de novas terapias em todo o mundo com a plataforma Prot-MaP da Protillion. Prot-MaP é a sigla para "Protein Display on a Massively Parallel Array" (Exibição de Proteínas em uma Matriz Massivamente Paralela). A plataforma realiza análises quantitativas de bibliotecas de proteínas por meio de um ciclo contínuo de feedback entre IA e dados experimentais de laboratório úmido, caracterizando milhões de variantes por execução para evitar o sobreajuste do modelo. Segundo a Protillion, o método pode identificar biológicos otimizados com propriedades terapêuticas complexas, como depuração dependente de pH e especificidade para múltiplos alvos, características difíceis de alcançar com métodos tradicionais. A plataforma gera dezenas de milhões de aglomerados de proteínas imobilizadas diretamente no fluxo de sequenciamento de DNA da Illumina, por meio de transcrição e tradução in situ eficientes e conectadas.
O Prot-MaP foi inventado pelo CEO e cofundador da Protillion, Curtis Layton, e pelo cofundador Dr. Will Greenleaf (professor de genética na Stanford School of Medicine e membro do conselho consultivo científico da Protillion). Após obter seu doutorado em biologia computacional pela Duke University, Layton atuou como pesquisador de pós-doutorado no Departamento de Genética da Stanford School of Medicine, sob a orientação de Greenleaf. Layton desenvolveu o Prot-MaP no laboratório de Greenleaf e, em seguida, fundou a Protillion em 2019 para comercializar a tecnologia. O trabalho de Layton inaugurou um novo método de sondagem de sistemas bioquímicos em alto rendimento, integrando engenharia de proteínas, tecnologia de sequenciamento de próxima geração, biologia molecular, transcrição e tradução in vitro, biologia computacional, desenvolvimento de software e várias disciplinas de engenharia.
O Dr. Robert Hollingsworth, diretor científico da Protillion, informou ao Genetic Engineering & Biotechnology News (GEN) que a plataforma Prot-MaP pode testar milhões de interações proteicas simultaneamente, gerando grandes volumes de dados em dias, em vez de meses. A plataforma conecta testes de proteínas de alto rendimento a modelos proprietários de aprendizado de máquina, identificando rapidamente candidatos promissores a medicamentos, compreendendo seus mecanismos de ação e projetando versões aprimoradas. O Prot-MaP pode testar até 1 milhão de variantes de proteínas em um único experimento e gerar resultados em 48 horas. O Dr. Hollingsworth possui mais de 30 anos de experiência em biofarmacêuticos, tendo atuado como diretor científico da Shoreline Therapeutics e ocupado cargos na Pfizer (como vice-presidente e diretor científico de vacinas contra o câncer e imunoterapia), Pharmacia & Upjohn (posteriormente incorporada à Pfizer), GlaxoSmithKline (GSK) e MedImmune (adquirida pela AstraZeneca).
A Protillion afirma que sua estratégia difere da maioria das empresas, pois não depende principalmente da previsão computacional de estruturas proteicas, mas sim da geração direta de dados funcionais em larga escala e da identificação dos melhores candidatos terapêuticos com base em resultados experimentais reais. Ao gerar milhões de medições de proteínas em paralelo, a plataforma cria conjuntos de dados necessários para treinar modelos de aprendizado de máquina mais robustos. De acordo com Layton, a Protillion e a Merck já definiram um roteiro para o início da colaboração, com os dois primeiros projetos focados na área de doenças inflamatórias. Layton destacou que a capacidade da plataforma Prot-MaP não se limita à inflamação, sendo capaz de descobrir e desenvolver novos biológicos em uma ampla gama de áreas terapêuticas, com planos de expansão futura para outras áreas de doenças.
Nos últimos meses, a Merck iniciou várias parcerias focadas em tecnologia para complementar seus pipelines de câncer e imunologia, visando mitigar o impacto da expiração das exclusividades de patentes de seus medicamentos de grande sucesso, incluindo Keytruda® e Gardasil® 9, nos Estados Unidos e em outras regiões. Em março, a Merck assinou uma parceria de até US$ 22 bilhões com a Quotient Therapeutics para aplicar sua plataforma de genômica somática na descoberta de novos alvos medicamentosos para a doença inflamatória intestinal (DII); no mesmo mês, a Merck também iniciou uma colaboração com a Infinimmune para o desenvolvimento de candidatos a anticorpos usando sua plataforma de descoberta Anthrobody® e o modelo de linguagem de anticorpos GLIMPSE™, com pagamentos de marcos de até US$ 838 milhões. Além disso, a Merck iniciou parcerias separadas com Google Cloud, Tempus AI e a Mayo Clinic.
O Dr. Juan Alvarez, vice-presidente de biologia de descoberta da Merck Research Laboratories, declarou em um comunicado que a plataforma da Protillion oferece uma oportunidade convincente e que está ansioso para colaborar com a equipe no avanço desses projetos. A Protillion, sediada em Carlsbad, Califórnia, atualmente conta com 30 funcionários. A empresa afirma que continua expandindo sua equipe e instalações para apoiar seu pipeline interno e parcerias estratégicas de alto valor. A Illumina Ventures, braço de capital de risco da Illumina, é um dos investidores da Protillion, tendo co-liderado uma rodada de financiamento de US$ 18 milhões em 2022 com a ARCH Venture Partners. Layton afirmou que planeja contratar mais 6 funcionários em tempo integral até o final do ano.
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