De acordo com pt.wedoany.com-A NVIDIA lançou o NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit, um conjunto de ferramentas especializado para fluxos de trabalho de IA em ciências da vida.
Este kit integra bibliotecas, ferramentas e modelos abertos de ciências da vida desenvolvidos pela NVIDIA ao longo da última década, com o objetivo de auxiliar agentes de IA, cientistas e laboratórios no processamento de dados científicos, incluindo coleta de evidências, análise de descobertas, execução de experimentos computacionais e recomendação de próximos passos.
O kit pode ser utilizado para assistentes gerais, agentes científicos, plataformas de software e sistemas biofarmacêuticos internos, fornecendo ferramentas para resumir conhecimento científico, invocar modelos, avaliar resultados, inferir descobertas e executar tarefas subsequentes.
O kit inclui o NVIDIA BioNeMo e utiliza as tecnologias NVIDIA NIM microservices, NVIDIA Parabricks, NVIDIA NeMo e NVIDIA Nemotron, além de ferramentas de computação acelerada.
Mais de 50 empresas estão usando o kit para fluxos de trabalho que abrangem previsão de estrutura de proteínas, docking molecular, química generativa, análise genômica, design de proteínas e descoberta de biomarcadores.
Instituições como Arc Institute, Open Molecular Software Foundation e o Institute for Protein Design da Universidade de Washington (University of Washington’s Institute for Protein Design) estão colaborando com a NVIDIA para aplicar o BioNeMo em modelos de pesquisa e disponibilizá-los por meio de fluxos de trabalho baseados em agentes. A NVIDIA afirma que a parceria com o Institute for Protein Design melhorou o desempenho em tempo de execução de modelos como o RosettaFold3, com desempenho aproximadamente duas vezes superior ao da geração anterior.
A pesquisa em ciências da vida envolve orçamentos substanciais de P&D em instituições científicas e farmacêuticas. Fluxos de trabalho baseados em agentes ajudam os pesquisadores a iterar mais rapidamente, reduzir custos e aumentar a eficiência do trabalho científico. A NVIDIA afirma que o kit permite que desenvolvedores adaptem agentes gerais para uso em ciências da vida, ajudando pesquisadores a executar experimentos mais rapidamente, aprender com os resultados e encurtar o ciclo entre hipóteses e análises. Algumas empresas também estão expandindo esses fluxos de trabalho para ambientes laboratoriais físicos.
Agentes gerais podem ter dificuldade em lidar com fluxos de trabalho científicos, pois precisam inferir as ferramentas, entradas, saídas e contexto biológico corretos. A NVIDIA afirma que o BioNeMo Agent Toolkit foi projetado para ajudar os agentes a selecionar as ferramentas adequadas, interpretar resultados e apoiar análises científicas.
A NVIDIA está ajustando a plataforma BioNeMo para que os agentes possam invocar diretamente bibliotecas, modelos e frameworks. Isso inclui o modelo aberto NVIDIA Nemotron para inferência, a biblioteca NVIDIA NeMo RL para aprendizado por reforço e o blueprint NVIDIA NemoClaw para agentes capazes de colaborar entre tarefas, invocar ferramentas e interagir com dados.
Os NVIDIA NIM microservices são usados para acesso a modelos e execução de tarefas. O runtime NVIDIA OpenShell fornece o ambiente de execução para esses fluxos de trabalho.
Os fluxos de trabalho suportados pelo kit incluem: triagem virtual, onde agentes ajudam a identificar candidatos a fármacos de pequenas moléculas gerando e filtrando compostos, realizando docking em alvos, prevendo a força de ligação e filtrando por propriedades semelhantes a fármacos, com o sistema classificando os candidatos para revisão adicional; análise genômica e descoberta de alvos, onde agentes processam dados de sequenciamento em descobertas genéticas e alvos biológicos priorizados, com o NVIDIA Parabricks para alinhamento e detecção de variantes, modelos genômicos de base pontuando efeitos de variantes e agentes classificando alvos candidatos para estudos adicionais; design de ligantes de proteínas, onde agentes ajudam pesquisadores a projetar e avaliar computacionalmente ligantes candidatos antes do início do trabalho laboratorial; fluxos de trabalho de pesquisa biomédica, onde agentes conectam fontes de dados a modelos de inferência para tarefas como revisão de literatura, geração de protocolos, triagem de ensaios clínicos e farmacovigilância; e análise de imagens médicas, onde agentes processam, segmentam, sintetizam e analisam dados de imagens médicas para fluxos de trabalho como descoberta de biomarcadores e geração de evidências.
Empresas dos setores de tecnologia e ciências da vida estão usando o kit para fluxos de trabalho baseados em agentes. Desenvolvedores de agentes científicos, incluindo Anthropic, Edison Scientific, Lila Sciences, OpenAI e Owkin, estão integrando o BioNeMo para fluxos de trabalho de pesquisa e análise. A NVIDIA afirma que seus modelos e bibliotecas de análise ajudam a reduzir o tempo entre a geração de hipóteses e os resultados.
Plataformas de dados e ferramentas, incluindo Benchling, Certara, Databricks, Snowflake e Seqera, estão usando o BioNeMo Agent Toolkit para conectar sistemas de dados científicos a fluxos de trabalho de IA. As ferramentas BioNeMo ajudam os agentes a consultar conjuntos de dados biológicos e químicos, preparar entradas de modelos, iniciar fluxos de trabalho reproduzíveis, analisar saídas e retornar resultados dentro das plataformas usadas por cientistas e equipes de dados.
Empresas de diagnóstico e farmacêuticas, incluindo Lilly e Natera, estão usando o BioNeMo Agent Toolkit em seus fluxos de trabalho de descoberta, pesquisa translacional e análise clínica. Empresas de IA focadas em biologia, incluindo Boltz, Basecamp Research, Chai Discovery, Dyno, PerturbAI e Proxima, colaboraram com a NVIDIA para desenvolver ferramentas de fluxo de trabalho de design terapêutico baseadas em modelos. Empresas de software de descoberta de fármacos, incluindo Dassault Systèmes, Cadence (OpenEye) e Schrödinger, estão integrando funcionalidades do kit em aplicações científicas usadas em fluxos de trabalho de descoberta, permitindo que agentes coordenem tarefas de geração molecular, docking e previsão em ambientes de software existentes. Empresas de instrumentação laboratorial e automação, incluindo Automata, HighRes, Tecan, Thermo Fisher e Medra, estão usando ferramentas BioNeMo para conectar sistemas laboratoriais a fluxos de trabalho computacionais. Provedores de nuvem de IA e infraestrutura, incluindo Baseten, Modal e Nebius, estão usando o kit para suportar fluxos de trabalho de ciências da vida gerenciados, oferecendo APIs, computação gerenciada e ambientes de inferência, com o objetivo de apoiar a implantação de aplicações baseadas em BioNeMo para pesquisadores e empresas.
O BioNeMo Agent Toolkit e suas habilidades já estão disponíveis através da página de recursos para desenvolvedores da NVIDIA e no GitHub.
