Academia Chinesa de Ciências Agrícolas desenvolve novo método de análise de associação genômica em poliploides

De acordo com pt.wedoany.com-A equipe de Inovação e Desenvolvimento em Tecnologia e Aplicação de Genômica Agrícola do Instituto de Genômica Agrícola da Academia Chinesa de Ciências Agrícolas desenvolveu um novo método de análise de associação genômica em poliploides, resolvendo o desafio da análise genética em genomas poliploides complexos. Os resultados da pesquisa foram publicados na revista Nature Genetics.

Genomas poliploides contêm múltiplos conjuntos de cromossomos homólogos altamente semelhantes. A análise tradicional de associação genômica ampla requer primeiro o alinhamento preciso dos fragmentos sequenciados com o genoma de referência, seguido pela identificação dos genótipos individuais. No entanto, devido à alta similaridade entre os cromossomos homólogos, os fragmentos frequentemente são mapeados incorretamente, resultando em distorções nos resultados da análise.

Para resolver esse problema, a equipe de pesquisa propôs um novo método de análise de associação genômica ampla em poliploides que não depende do alinhamento com a sequência de referência. Esse método elimina a etapa complexa de montagem, identificando genes-chave relacionados a características por meio da "contagem" de fragmentos genéticos. A técnica já foi validada em arroz diploide, alfafa tetraploide, batata-doce hexaploide e cana-de-açúcar poliploide cultivada, e identificou genes-chave que controlam o acúmulo de açúcar e o perfilhamento em populações complexas de cana-de-açúcar selvagem. Este estudo fornece uma ferramenta poderosa para o melhoramento genético de precisão em culturas poliploides, com potencial para acelerar o processo de seleção de variedades superiores.

Esta pesquisa recebeu apoio do Fundo Nacional de Ciências Naturais da China e do Programa de Inovação em Ciência e Tecnologia da Academia Chinesa de Ciências Agrícolas.